桂子山石柱林景区是六合国家地质公园的核心景区，位于六合城北约17公里，与金牛湖景区紧邻，由六合城区经金江公路即可直达，交通便捷。桂子山石柱林被评列为金陵名胜之一，描述为“上溯万年，冲天赤焰三千丈；遨游六合，掷地琼林十万株”。从科学的角度讲，桂子山石柱林系千万年前火山爆发时，玄武岩浆喷射到地面冷却收缩后形成六棱型、五棱型等不同形态的“柱状节理”。现有的石柱林直观陡壁高达50余米，山体岩壁约有5万余根熔岩石柱，它们或直立、或倾斜，如修饰性开发后直观高度可达100米，雄伟壮观，令人称奇。
该地区原是一采石厂，1983年南京大学地质系教授徐克勤在周边地区作地质考察时，首次发现是比较规则的石柱林，后建议上级政府给予保护，并作为南京大学等高校的地质考察点。该奇迹被发现后，吸引了国内外地质界的浓厚兴趣，1987年被南京市列为金陵四十景之一，1996年8月被第三十届国际地质大会指定为代表考察地点，有意大利、丹麦等13个国家和地区的地质专家到现场考察，并给予了高度评价。
景区的平面布局可分为三部分。自金江公路桂子山入口到游客广场为引导区，地质博物馆为科普教育区，山体部分为奇迹观赏区。
引导区有供游客停车、休息的基本设施，建有“六合国家地质公园”的标志性建筑物—门碑，有近5000平方米的园林绿化景观，乡土气息浓烈。
六合国家地质公园博物馆，全面展示了地质公园的科学与文化，是青少年科普教育的重要基地。博物馆按顺序分为6个厅。一是接待和服务厅，为景区工作人员办公和游客接待的场所。二是多功能影视厅，有多媒体影像，介绍六合及桂子山景区的地质布局和特点，让游客详细了解六合全区的地质地貌和风土人情。三是模型厅，按照等比例的设计将六合全区各个地质景观的全貌，用实物反映给游客，让游客落脚桂子山就能对其他的景点有所认识。四是火山与石柱林展厅，通过23块地质资料展板和部分实物，让游客充分了解到世界各地和中国的火山分布，各地的火山类型及特点，了解石柱林的形成过程及特点，增加游客对火山的感性认识。五是火山爆发演示厅，在图片介绍火山科学知识的基础上，制作火山喷发实物模型演示。融合喷发系统、声光电系统、软件控制系统、模拟岩浆流演示系统、热感系统等为一体，演示火山喷发实景，让游客有亲临火山喷发现场的真实感觉。六是雨花石与文化展厅，展示南京特产六合雨花石和中国现代民间艺术四合农民画，在实物和作品展览的基础上，安排农民作者现场创作，供游客观赏和收藏。
走出地质博物馆，就进入奇迹观赏区。沿着蜿蜒曲折的游客登山步道，可以登临桂子山顶，既可俯视近处的农家田园风光，也可远眺金牛湖和冶山的山湖景色，有心旷神怡之感。从步道下到山脚，石柱参天景观尽收眼底。熔岩石柱呈五棱或六棱整齐排列，耸立而呈石柱崖，其北侧为倾斜石柱。石柱约有5万余根，宽40-50cm，每段高达10-35cm，巍然壮观，备受国内外专家学者赞赏。
交通指南景区地址：江苏省南京市六合区冶山镇桂子山
乘车线路：从南京乘玉桥—六合、中山南路—六合或中央门—六合公交线路到六合南门，转乘六合—冶山专线即到
自驾线路：南京市区 — 宁六公路 — 金江公路 — 六合公路 — 石柱林